Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
THUMPD3Q9BV44 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD3Q9BV44 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms