Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB6Q9BUF5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms