Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPON2Q9BUD6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPON2Q9BUD6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPON2Q9BUD6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms