Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEC22CQ9BRL7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms