Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 324.69■■□□□ 1.546e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-206ENST00000504265 877 ntTSL 224.35■■□□□ 1.492e-9■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.456e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-213ENST00000505656 975 ntTSL 522.33■■□□□ 1.176e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 CRIPT-202ENST00000486447 1724 ntTSL 522.12■■□□□ 1.136e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ATIC-204ENST00000427397 1046 ntTSL 521.39■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-221ENST00000512181 1456 ntTSL 220.63■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SAPCD1-210ENST00000433778 607 ntTSL 319.08■□□□□ 0.646e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SP4-202ENST00000432066 377 ntTSL 518.82■□□□□ 0.66e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-217ENST00000511347 1035 ntTSL 518.19■□□□□ 0.56e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-202ENST00000546778 1146 ntTSL 218.04■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-205ENST00000503127 2734 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ATIC-208ENST00000444305 569 ntTSL 417.85■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-225ENST00000515619 818 ntTSL 517.82■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.376e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 217.24■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-228ENST00000635113 1706 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.226e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SP4-203ENST00000440636 288 ntTSL 315.64■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-220ENST00000511937 2669 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 TRIM65-205ENST00000591668 644 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-208ENST00000504334 3539 ntTSL 214.01□□□□□ -0.176e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ARHGAP21-211ENST00000476499 1612 ntTSL 213.79□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SPATA20-204ENST00000503063 3232 ntTSL 213.6□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ATIC-214ENST00000488712 744 ntTSL 312.55□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 GTF2H4-203ENST00000453897 598 ntTSL 511.96□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-207ENST00000549682 596 ntTSL 411.68□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SP4-204ENST00000448246 4293 ntTSL 510.99□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 TRIM65-206ENST00000592642 396 ntTSL 310.78□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 CRIPT-201ENST00000238892 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.816e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-214ENST00000552453 856 ntTSL 59.68□□□□□ -0.866e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ATIC-202ENST00000413174 695 ntTSL 59.63□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-213ENST00000551407 544 ntTSL 49.52□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-203ENST00000547604 276 ntTSL 39.52□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-204ENST00000547620 567 ntTSL 49.01□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-208ENST00000549944 815 ntTSL 58.52□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-212ENST00000550876 564 ntTSL 47.93□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZDHHC17-209ENST00000550163 730 ntTSL 37.3□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ARHGAP21-204ENST00000416305 801 ntTSL 56.99□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ARHGAP21-219ENST00000636842 551 ntTSL 56.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ARHGAP21-216ENST00000493154 716 ntTSL 54.9□□□□□ -1.636e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ATP2C1-222ENST00000514654 4730 ntTSL 1 (best)6.58□□□□□ -1.365e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 ATP2C1-207ENST00000504612 3148 ntTSL 26.17□□□□□ -1.425e-8■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 28.6
BUD13Q9BRD0 USP21-208ENST00000487163 2514 ntTSL 1 (best)18.24■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 USP21-205ENST00000482385 745 ntTSL 38.05□□□□□ -1.127e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)23.93■■□□□ 1.423e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 521.98■■□□□ 1.113e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 13e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.953e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 GRK6-205ENST00000506296 955 ntTSL 520.7■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.883e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 520.52■□□□□ 0.883e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-14■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 417.85■□□□□ 0.458e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-207ENST00000597112 1728 ntTSL 217.81■□□□□ 0.448e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-216ENST00000602095 617 ntTSL 317.72■□□□□ 0.438e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-206ENST00000596966 583 ntTSL 316.13■□□□□ 0.178e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 GRK6-207ENST00000508705 744 ntTSL 515□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-213ENST00000600924 605 ntTSL 413.3□□□□□ -0.288e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-204ENST00000594760 549 ntTSL 411.02□□□□□ -0.658e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.698e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 GYS1-206ENST00000496048 536 ntTSL 38.52□□□□□ -1.054e-8■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.138e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.28e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.288e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 TRIP12-216ENST00000487178 977 ntTSL 26.79□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.48e-16■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 423.09■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 220.62■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 ZZZ3-204ENST00000433749 603 ntTSL 47.38□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 28.5
BUD13Q9BRD0 POLE-211ENST00000538196 551 ntTSL 414.8□□□□□ -0.049e-8■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 ST6GALNAC1-211ENST00000592042 2657 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 ST6GALNAC1-202ENST00000359088 2321 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 ST6GALNAC1-201ENST00000156626 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 ST6GALNAC1-204ENST00000588375 633 ntTSL 311.76□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 ST6GALNAC1-203ENST00000585633 667 ntTSL 310.87□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.492e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.292e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-204ENST00000588691 281 ntTSL 326.73■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.872e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 526.02■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-12■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.241e-12■■■■■ 28.4
BUD13Q9BRD0 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 213.56□□□□□ -0.241e-12■■■■■ 28.4
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 673.5 ms