Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FYCO1Q9BQS8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FYCO1Q9BQS8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FYCO1Q9BQS8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms