Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM83CQ9BQN1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM83CQ9BQN1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM83CQ9BQN1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms