Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms