Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOL4Q9BPW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
APOL4Q9BPW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOL4Q9BPW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms