Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKP2Q99959 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP2Q99959 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms