Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITX2Q99697 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITX2Q99697 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms