Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMS19Q96T76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms