Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNKPQ96T60 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms