Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A9Q96Q91 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A9Q96Q91 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms