Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSPG4P5Q96PW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSPG4P5Q96PW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSPG4P5Q96PW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms