Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UHRF2Q96PU4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UHRF2Q96PU4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms