Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSK3Q96PN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSK3Q96PN8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms