Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LRRC7Q96NW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LRRC7Q96NW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC7Q96NW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms