Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEUROD6Q96NK8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD6Q96NK8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD6Q96NK8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms