Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF488Q96MN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms