Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf85Q96MD7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf85Q96MD7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms