Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00615Q96LM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00615Q96LM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms