Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM47Q96LD4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM47Q96LD4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms