Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNDP1Q96KN2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNDP1Q96KN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms