Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPIP1Q96JH7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCPIP1Q96JH7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCPIP1Q96JH7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms