Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC12Q96J65 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ABCC12Q96J65 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCC12Q96J65 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms