Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM46AQ96IP4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM46AQ96IP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46AQ96IP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46AQ96IP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46AQ96IP4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46AQ96IP4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46AQ96IP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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