Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM17Q96I25 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM17Q96I25 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms