Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGSM3Q96HU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGSM3Q96HU1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGSM3Q96HU1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1224 ms