Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRELD1Q96HD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms