Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALML4Q96GE6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms