Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LTV1Q96GA3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LTV1Q96GA3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTV1Q96GA3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms