Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms