Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP6Q96FZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP6Q96FZ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms