Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC97Q96F63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC97Q96F63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms