Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUS1Q96E22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUS1Q96E22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUS1Q96E22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms