Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM44Q96DX7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM44Q96DX7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms