Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL38Q96DV4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL38Q96DV4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms