Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHDC3Q96DC8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHDC3Q96DC8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms