Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ULK4Q96C45 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK4Q96C45 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK4Q96C45 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms