Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX58Q96C10 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms