Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC127Q96BQ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC127Q96BQ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms