Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF34Q969K3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF34Q969K3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms