Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TSLPQ969D9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSLPQ969D9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms