Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-CQ95604 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-CQ95604 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-CQ95604 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms