Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DPF3Q92784 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPF3Q92784 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPF3Q92784 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms