Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL2Q92772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL2Q92772 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms