Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNRQ92752 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TNRQ92752 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNRQ92752 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TNRQ92752 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNRQ92752 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNRQ92752 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNRQ92752 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNRQ92752 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNRQ92752 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNRQ92752 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNRQ92752 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNRQ92752 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNRQ92752 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNRQ92752 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNRQ92752 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNRQ92752 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
TNRQ92752 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNRQ92752 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNRQ92752 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNRQ92752 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNRQ92752 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNRQ92752 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TNRQ92752 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNRQ92752 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNRQ92752 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNRQ92752 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNRQ92752 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNRQ92752 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNRQ92752 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TNRQ92752 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNRQ92752 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TNRQ92752 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNRQ92752 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TNRQ92752 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNRQ92752 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNRQ92752 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNRQ92752 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNRQ92752 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNRQ92752 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNRQ92752 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNRQ92752 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNRQ92752 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNRQ92752 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms