Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERVK_113Q902F9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERVK_113Q902F9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERVK_113Q902F9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms