Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms